厦门市第三医院始创于1920年，前身为同安医院，2003年12月正式更名为厦门市第三医院，2006年9月26日，成为福建省中医药大学临床教学医院，2012年5月经省卫生厅、教育厅批准，成为福建省中医药大学第四临床医学院、福建中医药大学附属厦门第三医院，是岛外一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的大型三级综合性医院、国家级爱婴医院、“省级文明医院”、福建医科大学、福建中医药大学临床教学医院、福建省临床住院医师规范化培训基地、国家级住院医师规范化培训基地、于金明院士平台协助医院。
医院编制床位1000张，占地面积140亩，建筑面积12.8万平方米，内设44个临床、医技科室，16个职能科室，医护人员近1500人，拥有如：ECMO（体外膜肺氧合）、德国西门子Prisma科研型 3.0T磁共振、联影3.0T超导核磁共振机、美国GE 256排512层螺旋CT、128排螺旋CT、ECT、西门子数字C臂血管造影(DSA)、1000毫安数字胃肠机、数字DR拍片机、直线加速器、全自动呼吸机、人工肝、血液净化机、高压氧舱、全自动麻醉机、美国全自动生化仪、超细电子胃镜、结肠镜、电子气管镜、三维彩超等一系列先进医疗设备，拥有复合手术室在内的净化手术室15间等。
医院拥有邱海波名医工作室、林江涛名医工作室两大市级名医工作室，ICU、妇产科、神经外科、骨科、手足外科、普外科、神经内科、呼吸内科等优势学科快速发展，在高新技术治疗方面达到较高水平，如重症医学科精准开展俯卧位通气、VV-ECMO救治技术、VA -ECMO救治技术等高难度治疗手段，重症患者救治水平得到快速提升；微创治疗常规开展，如：宫颈癌、食道癌、肺癌、结直肠癌、胃癌、骨关节及颅脑微创腔镜手术达前沿水平。
医院也是岛外最早能开展断肢/指再植、脑出血介入治疗、心肌梗死介入治疗的综合性医院，同时又是岛外有高压氧舱治疗紧急中毒能力和有放射治疗设备用于肿瘤放射治疗的综合性医院，岛外较早能独立进行心脏复杂手术的综合性医院。
目前，医院已成为中国卒中联盟综合卒中中心、国家脑防委颅内血肿燥创穿刺清除术协作医院、中国创伤救治联盟创伤救治中心建设单位、国家区域医疗中心神经外科联盟单位、中国肺癌防治联盟肺结节诊治中心、国家心血管病中心高血压专病医联体分中心、国家心血管病中心心力衰竭专病医联体成员单位、国家级胸痛中心建设单位；成为中国糖尿病足联盟福建省首家“糖尿病足防治中心建设单位”、中华足踝医学教育学院在闽首个继续教育培训基地、中国中西医结合学会骨伤科专业委员会足踝专家工作委员会在闽设立的首个足踝外科培训基地。
百年风华、百年三院，记载着三院人“医者仁心”和“以人为本”的服务宗旨。新的百年号角已经吹响，我们将上下一心、团结一致，为实现医疗科技更加先进，医疗成果更加丰硕，早日跻身“三甲医院”宏伟目标，为人民群众提供更好的医疗服务，努力奋斗!
